Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF13Q86YI8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF13Q86YI8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms