Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPFIBP1Q86W92 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIBP1Q86W92 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms