Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP7Q86V35 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CABP7Q86V35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CABP7Q86V35 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms