Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX20Q7Z614 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX20Q7Z614 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms