Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS2ST1Q7LGA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HS2ST1Q7LGA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms