Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPUQ71F23 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPUQ71F23 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPUQ71F23 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPUQ71F23 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms