Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00173Q6ZV60 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms