Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC149Q6ZUS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC149Q6ZUS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms