Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPGS1Q6ZTW0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPGS1Q6ZTW0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms