Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00299Q6ZSB3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms