Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC73Q6ZRK6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC73Q6ZRK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC73Q6ZRK6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms