Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB5

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZNB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q6ZNB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q6ZNB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms