Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM72Q6ZMU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM72Q6ZMU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms