Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKAL1Q6UXT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKAL1Q6UXT8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKAL1Q6UXT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms