Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SBSNQ6UWP8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SBSNQ6UWP8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SBSNQ6UWP8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms