Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCIMPQ6UWF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCIMPQ6UWF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms