Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRAIDQ6UW56 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRAIDQ6UW56 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms