Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms