Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L2Q6R6M4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L2Q6R6M4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms