Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDF2Q6PJF5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms