Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE2Q6PIF2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE2Q6PIF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE2Q6PIF2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE2Q6PIF2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE2Q6PIF2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE2Q6PIF2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms