Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1Q6PCB7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC27A1Q6PCB7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1Q6PCB7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms