Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JMJD6Q6NYC1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
JMJD6Q6NYC1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JMJD6Q6NYC1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JMJD6Q6NYC1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JMJD6Q6NYC1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD6Q6NYC1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD6Q6NYC1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms