Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD54Q6NXT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms