Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF40BQ6NWY9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF40BQ6NWY9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms