Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H2AA3Q6FI13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms