Protein–RNA interactions for Protein: Q6DHV5

CC2D2B, Protein CC2D2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2BQ6DHV5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2BQ6DHV5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CC2D2BQ6DHV5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CC2D2BQ6DHV5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CC2D2BQ6DHV5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms