Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATL3Q6DD88 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATL3Q6DD88 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATL3Q6DD88 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms