Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCNX4Q63HM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX4Q63HM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms