Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CHIC1Q5VXU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms