Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SAMD13Q5VXD3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms