Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYDE2Q5VT97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYDE2Q5VT97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYDE2Q5VT97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms