Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RPRD2Q5VT52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPRD2Q5VT52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPRD2Q5VT52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms