Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3BQ5T9A4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms