Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HP1BP3Q5SSJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HP1BP3Q5SSJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms