Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf10Q5SRN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf10Q5SRN2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms