Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACER2Q5QJU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACER2Q5QJU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER2Q5QJU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms