Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
FRMPD3Q5JV73 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD3Q5JV73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms