Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTL5Q5HYW3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTL5Q5HYW3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTL5Q5HYW3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RTL5Q5HYW3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms