Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM41BQ5BJD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM41BQ5BJD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM41BQ5BJD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms