Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLL1Q53SF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLL1Q53SF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms