Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD39Q53RE8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms