Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC23Q53EV4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC23Q53EV4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms