Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPAT3Q53EU6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms