Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN2Q52LD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN2Q52LD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFTN2Q52LD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms