Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUSP28Q4G0W2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
DUSP28Q4G0W2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms