Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF260Q3ZCT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF260Q3ZCT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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