Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms