Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H1Q32P28 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H1Q32P28 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H1Q32P28 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms