Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTU2Q2VPK5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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